More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  100 
 
 
601 aa  1190    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  31.33 
 
 
573 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  31.1 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.48 
 
 
567 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.57 
 
 
575 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  30.83 
 
 
560 aa  200  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  30.36 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  30.36 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  30.56 
 
 
570 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.31 
 
 
583 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  28.7 
 
 
585 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.23 
 
 
586 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  29.35 
 
 
572 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  29.4 
 
 
570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  29.4 
 
 
570 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  28.95 
 
 
568 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.3 
 
 
568 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.3 
 
 
568 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.24 
 
 
578 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.07 
 
 
565 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.64 
 
 
574 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  30.47 
 
 
599 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  28.23 
 
 
576 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  29.11 
 
 
595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  27.42 
 
 
576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  26.18 
 
 
585 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  27.1 
 
 
591 aa  185  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  29.91 
 
 
585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  28.32 
 
 
575 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.29 
 
 
588 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  27.31 
 
 
565 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  30.6 
 
 
590 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.88 
 
 
580 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  26.53 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  27.82 
 
 
572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  29.37 
 
 
574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  27.27 
 
 
585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.36 
 
 
573 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  28.74 
 
 
558 aa  173  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  28.55 
 
 
591 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  25.83 
 
 
585 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  29.24 
 
 
590 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  30.88 
 
 
587 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  29.66 
 
 
592 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  25.31 
 
 
585 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  25.31 
 
 
585 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  25.31 
 
 
585 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  26.57 
 
 
571 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  25.31 
 
 
585 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  25.65 
 
 
585 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  26.98 
 
 
590 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  30.15 
 
 
574 aa  171  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  26.45 
 
 
582 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  29.43 
 
 
586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.01 
 
 
570 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  30.43 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  28.33 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  28.33 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.51 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  29.52 
 
 
585 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  29.14 
 
 
550 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  27.53 
 
 
567 aa  165  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  29.14 
 
 
570 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.4 
 
 
588 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  25.27 
 
 
566 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  33.75 
 
 
556 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  26.88 
 
 
592 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  26.97 
 
 
605 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  29.02 
 
 
570 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  28.12 
 
 
576 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  25.35 
 
 
600 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  26.04 
 
 
578 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  27.29 
 
 
584 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  33.25 
 
 
556 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  27.59 
 
 
563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  27.12 
 
 
730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  27.46 
 
 
608 aa  156  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  30.7 
 
 
569 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  28.43 
 
 
556 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  25.5 
 
 
606 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  26.39 
 
 
567 aa  154  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  24.95 
 
 
578 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  27 
 
 
571 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  26.76 
 
 
567 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  34.83 
 
 
551 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  25 
 
 
588 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  32.4 
 
 
556 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.1 
 
 
553 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  25.78 
 
 
574 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  27.5 
 
 
559 aa  150  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  30.3 
 
 
576 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  25.88 
 
 
711 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  25.73 
 
 
586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  28.26 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  27.51 
 
 
551 aa  148  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  28.38 
 
 
565 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  24.53 
 
 
581 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.24 
 
 
570 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  27.84 
 
 
570 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  27.84 
 
 
570 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>