263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0019 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0019  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  680    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.846659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0037  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  91.69 
 
 
325 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000954073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  28.99 
 
 
348 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  27.9 
 
 
349 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  27.76 
 
 
352 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  27.76 
 
 
352 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  27.25 
 
 
349 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  27.43 
 
 
352 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  27.22 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  27.45 
 
 
349 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.5 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  27.45 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  35.81 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.77 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.31 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.12 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.24 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.02 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  33.02 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.38 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.02 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  32.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  34.29 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  32.38 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.08 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.08 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  32.08 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.08 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.58 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.55 
 
 
545 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  32.08 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.08 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  47.62 
 
 
377 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.29 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.27 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.61 
 
 
222 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.66 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.91 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.46 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.55 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.9 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  36.9 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.08 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.28 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.03 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  23.55 
 
 
599 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.62 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.55 
 
 
599 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  45.31 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.59 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  42.86 
 
 
377 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.16 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  42.86 
 
 
386 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.28 
 
 
419 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
377 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  46.03 
 
 
372 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.03 
 
 
372 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.39 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  27.84 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.16 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  31.69 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.14 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  31.36 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  38.75 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.77 
 
 
460 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  42.37 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.38 
 
 
644 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.97 
 
 
597 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.94 
 
 
265 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.74 
 
 
225 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.03 
 
 
225 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30 
 
 
464 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  39.68 
 
 
225 aa  57  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  43.55 
 
 
378 aa  56.6  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.28 
 
 
382 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.94 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  45.16 
 
 
380 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  39.68 
 
 
227 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  39.68 
 
 
227 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  37.8 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  41.27 
 
 
367 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  39.68 
 
 
227 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.8 
 
 
399 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>