217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0128 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 
66 aa  130  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 
66 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  69.7 
 
 
403 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  69.7 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  68.66 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  68.66 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  68.66 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  73.02 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 
66 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 
66 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 
66 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 
66 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  68.75 
 
 
66 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  64.18 
 
 
67 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  62.12 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  73.6  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  70.5  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  47.62 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  39.39 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  49.21 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  44.44 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2907  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  46.03 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  39.68 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>