26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0059 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  100 
 
 
118 aa  225  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  40.59 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  33.61 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  36.46 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  34 
 
 
146 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  31.68 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  28.57 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  44.29 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  38.27 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  39.24 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3106  hypothetical protein  34.69 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  34.58 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  33.96 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  37.38 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.308425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002239  hypothetical protein  31.68 
 
 
124 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1230  VanZ family protein  39.29 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.794314  hitchhiker  0.00101511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  32.99 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  30.56 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  34.02 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  34.02 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  31.96 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  31.96 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  36.92 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  39.24 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  35.42 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  34.02 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>