More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01540 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.25 
 
 
870 aa  790    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  56.6 
 
 
824 aa  872    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  49.94 
 
 
812 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  47.45 
 
 
865 aa  746    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  47.45 
 
 
940 aa  708    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  44.65 
 
 
832 aa  717    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  58.25 
 
 
817 aa  953    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.39 
 
 
811 aa  951    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.19 
 
 
861 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.27 
 
 
874 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.39 
 
 
811 aa  951    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  59.39 
 
 
811 aa  951    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  59.39 
 
 
811 aa  951    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.29 
 
 
858 aa  708    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.29 
 
 
858 aa  709    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  45.56 
 
 
854 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  46.65 
 
 
865 aa  736    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  77.18 
 
 
830 aa  1273    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  55.95 
 
 
855 aa  937    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  46.49 
 
 
873 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  59 
 
 
823 aa  955    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  45.74 
 
 
872 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  56.93 
 
 
814 aa  910    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  45.95 
 
 
854 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  49.82 
 
 
847 aa  800    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.42 
 
 
862 aa  710    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  57.44 
 
 
843 aa  934    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  48.1 
 
 
863 aa  738    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  57.18 
 
 
846 aa  939    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  47.15 
 
 
864 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.39 
 
 
811 aa  951    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  57.49 
 
 
842 aa  951    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  58.66 
 
 
824 aa  944    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  45 
 
 
870 aa  708    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  58.23 
 
 
840 aa  889    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  76.9 
 
 
834 aa  1238    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  46.04 
 
 
879 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  45.11 
 
 
859 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  45.58 
 
 
865 aa  707    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  44.36 
 
 
854 aa  706    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  45.76 
 
 
871 aa  706    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2548  ClpB protein  46.15 
 
 
876 aa  700    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  47.86 
 
 
949 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  47.87 
 
 
961 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  46.1 
 
 
879 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  45.69 
 
 
860 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  47.08 
 
 
865 aa  738    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  48.06 
 
 
818 aa  747    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  47.18 
 
 
878 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  46.19 
 
 
862 aa  726    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  45.69 
 
 
859 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  45.22 
 
 
848 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  75.75 
 
 
847 aa  1229    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  53.19 
 
 
837 aa  780    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  50.79 
 
 
886 aa  748    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  63.55 
 
 
834 aa  1035    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.55 
 
 
848 aa  779    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.6 
 
 
814 aa  851    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  52.6 
 
 
814 aa  850    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  45.64 
 
 
856 aa  702    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  45.5 
 
 
870 aa  713    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  58.56 
 
 
825 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  55.93 
 
 
825 aa  914    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  45.89 
 
 
864 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  57.11 
 
 
828 aa  928    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  46.28 
 
 
854 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.65 
 
 
823 aa  765    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  47.27 
 
 
838 aa  753    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  50.31 
 
 
826 aa  778    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  84.02 
 
 
830 aa  1377    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  45.9 
 
 
873 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  78.56 
 
 
839 aa  1282    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  46.21 
 
 
864 aa  713    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  49.94 
 
 
854 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  76.58 
 
 
861 aa  1262    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  45.22 
 
 
848 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  75.75 
 
 
847 aa  1229    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  45.33 
 
 
848 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  75.18 
 
 
847 aa  1236    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  45.41 
 
 
859 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  46.88 
 
 
949 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  44.97 
 
 
870 aa  701    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  57.61 
 
 
842 aa  947    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  57.37 
 
 
843 aa  951    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  55.95 
 
 
855 aa  939    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  55.57 
 
 
859 aa  925    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  57.89 
 
 
818 aa  962    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1019  ATPase  46.55 
 
 
857 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00163715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  45.22 
 
 
848 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  75.75 
 
 
847 aa  1241    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  57.68 
 
 
841 aa  951    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  59.8 
 
 
812 aa  979    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  75.27 
 
 
847 aa  1228    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  57.41 
 
 
840 aa  891    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  53.12 
 
 
848 aa  726    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  74.35 
 
 
844 aa  1226    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1024  ATPase  46.77 
 
 
857 aa  704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3639  ATPase  46.82 
 
 
854 aa  703    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2583  ATPase  46.11 
 
 
848 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.444308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  56.72 
 
 
824 aa  876    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>