30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00240 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00240  ParB-like nuclease  100 
 
 
336 aa  678    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06610  ParB-like nuclease  72.06 
 
 
336 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0826  ParB domain protein nuclease  48.06 
 
 
333 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2187  ParB-like nuclease domain-containing protein  37.25 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3031  ParB domain protein nuclease  37.89 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0756  hypothetical protein  35.87 
 
 
133 aa  58.9  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12665  hypothetical protein  40.96 
 
 
154 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.39723e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  30.37 
 
 
447 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4529  nuclease  31.36 
 
 
270 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  36.94 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  45.61 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  37.5 
 
 
282 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  39.08 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  36.9 
 
 
284 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  32.43 
 
 
294 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  40.23 
 
 
358 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1166  nuclease  38.24 
 
 
79 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.53 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  35.65 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  37.21 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  32.77 
 
 
401 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3186  parB-like partition protein  36 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000842796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  34.48 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  30 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  34.48 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  34.48 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1762  parB-like partition protein  29.66 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  34.86 
 
 
597 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  44.23 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  34.55 
 
 
279 aa  42.7  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>