49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1107 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  44.44 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  43.28 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  36.67 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  39.6 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  35.25 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  36.28 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  39.52 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  42.05 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  34.31 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.32 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  32.46 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  27.41 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  28.23 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  30.51 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.43 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  30.7 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  30.37 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  29.27 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.76 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  26.87 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  27.61 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  25.19 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  22.73 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  26.17 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.4 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  27.68 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  28.45 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  24.35 
 
 
148 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  21.43 
 
 
142 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  27.14 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  22.48 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  24.17 
 
 
292 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  25.74 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>