27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1721 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  31.65 
 
 
266 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  28.04 
 
 
263 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  29.86 
 
 
252 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.36 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  32 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  30.56 
 
 
256 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  28.44 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  24.41 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  28 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  28 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  28 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  29.68 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  25.96 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  26.67 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.76 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  25.62 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  26.24 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  22.77 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  26.82 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  27.67 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  29.33 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  23.35 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  21.51 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  19.29 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  34.25 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>