More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl088 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  53.72 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  39.04 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  41.15 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  37.08 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  34.02 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.64 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.57 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.77 
 
 		 327 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  34.02 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.47 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  31.82 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  33.47 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.4 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.07 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  35 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.07 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  33.47 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.98 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  34.98 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.34 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.57 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.67 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.98 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  36.21 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  28.34 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.1 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.1 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.51 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.98 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.11 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.21 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  27.8 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.51 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.22 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.79 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  33.47 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.87 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  30.04 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  28.22 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  29.51 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  26.56 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.41 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  28.1 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  35.8 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  28.29 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  26.56 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  39.67 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  33.69 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.15 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  26.56 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.83 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.41 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  39.67 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  34.95 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  30.21 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.8 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.54 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.96 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.41 
 
 		 387 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.15 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.99 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.64 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  28.29 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  31.17 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.06 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  31.17 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.4 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2969  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.34 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  29.54 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.29 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.43 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  27.05 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  27.35 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.35 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  26.12 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.84 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0533  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.64 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.51 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  26.42 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>