More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4436 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
144 aa  289  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  61.19 
 
 
151 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 
142 aa  156  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 
168 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  56.1 
 
 
141 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  54.07 
 
 
139 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  52.59 
 
 
140 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  53.49 
 
 
142 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  53.49 
 
 
142 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  50 
 
 
138 aa  151  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  55.12 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 
140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  54.33 
 
 
141 aa  147  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  52.71 
 
 
144 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  51.88 
 
 
137 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  50.74 
 
 
140 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 
137 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  51.18 
 
 
135 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  52.76 
 
 
135 aa  143  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  48.85 
 
 
137 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  48.85 
 
 
137 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  48.48 
 
 
156 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 
151 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 
149 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  52.27 
 
 
158 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  51.15 
 
 
138 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  51.18 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  48.8 
 
 
150 aa  137  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  48.44 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 
165 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  48 
 
 
143 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  50.39 
 
 
142 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  46.4 
 
 
143 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  43.8 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  49.19 
 
 
140 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  40.94 
 
 
135 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  39.86 
 
 
143 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  43.31 
 
 
176 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  37.98 
 
 
135 aa  100  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  37.98 
 
 
135 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  40.46 
 
 
139 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  42.52 
 
 
136 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  38.35 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 
148 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
167 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  38.17 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  37.04 
 
 
155 aa  97.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  39.53 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  39.53 
 
 
167 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  38.28 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  38.28 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  38.58 
 
 
153 aa  95.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  38.71 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  38.71 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  33.82 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
152 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  38.28 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  36.64 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 
144 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  42.62 
 
 
167 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  37.04 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.12 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  37.01 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  36.89 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 
147 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  37.7 
 
 
143 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
161 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  37.01 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  41.86 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  39.68 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  37.8 
 
 
143 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  41.8 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  38.52 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  37.9 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.89 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>