More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1629 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.38 
 
 
1004 aa  706    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  45.28 
 
 
996 aa  780    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  51.41 
 
 
1032 aa  787    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
979 aa  1997    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.99 
 
 
993 aa  969    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  72 
 
 
982 aa  1435    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.15 
 
 
989 aa  992    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.85 
 
 
1004 aa  818    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  44.3 
 
 
1020 aa  759    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.47 
 
 
996 aa  767    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.69 
 
 
996 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.04 
 
 
993 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.69 
 
 
996 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  72.6 
 
 
979 aa  1462    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.67 
 
 
1007 aa  812    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  44.75 
 
 
996 aa  771    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.36 
 
 
989 aa  994    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.39 
 
 
996 aa  760    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  51.02 
 
 
989 aa  998    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47 
 
 
996 aa  774    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.96 
 
 
999 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  42.91 
 
 
993 aa  696    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.62 
 
 
995 aa  697    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.78 
 
 
993 aa  720    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0812  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.49 
 
 
946 aa  627  1e-178  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.4 
 
 
953 aa  609  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.26 
 
 
953 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.69 
 
 
953 aa  591  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0482  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.73 
 
 
998 aa  587  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0432  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  39.82 
 
 
1009 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117579  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39 
 
 
966 aa  575  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.54 
 
 
981 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.24 
 
 
985 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.05 
 
 
959 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.85 
 
 
973 aa  536  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.95 
 
 
945 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.58 
 
 
947 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.11 
 
 
766 aa  479  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0534  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.47 
 
 
800 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.6525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.12 
 
 
962 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.72 
 
 
768 aa  393  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  31.94 
 
 
765 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.87 
 
 
767 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.96 
 
 
742 aa  307  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31 
 
 
733 aa  307  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.48 
 
 
742 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.3 
 
 
759 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.61 
 
 
741 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.66 
 
 
758 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 
764 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.47 
 
 
733 aa  303  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.49 
 
 
733 aa  303  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  33.2 
 
 
754 aa  303  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.07 
 
 
732 aa  301  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.21 
 
 
759 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.46 
 
 
758 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.73 
 
 
740 aa  298  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.83 
 
 
751 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.4 
 
 
736 aa  295  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.43 
 
 
759 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.79 
 
 
742 aa  293  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.46 
 
 
715 aa  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.32 
 
 
746 aa  293  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.86 
 
 
752 aa  292  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.59 
 
 
739 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.38 
 
 
761 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.45 
 
 
739 aa  290  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.59 
 
 
739 aa  290  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.32 
 
 
739 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.45 
 
 
739 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.9 
 
 
751 aa  289  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.45 
 
 
739 aa  289  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.32 
 
 
758 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.45 
 
 
739 aa  289  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.62 
 
 
798 aa  288  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.37 
 
 
739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.51 
 
 
769 aa  288  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.86 
 
 
739 aa  288  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.52 
 
 
767 aa  287  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.08 
 
 
738 aa  287  8e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.32 
 
 
739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.55 
 
 
741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.32 
 
 
739 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.22 
 
 
764 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.65 
 
 
767 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.34 
 
 
777 aa  284  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.24 
 
 
761 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.29 
 
 
781 aa  283  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.81 
 
 
727 aa  283  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.42 
 
 
752 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.57 
 
 
787 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.21 
 
 
775 aa  282  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.01 
 
 
715 aa  281  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.93 
 
 
724 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.59 
 
 
764 aa  280  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.86 
 
 
765 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.19 
 
 
807 aa  280  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  32.3 
 
 
727 aa  279  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.3 
 
 
754 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.75 
 
 
743 aa  278  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>