More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2114 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
328 aa  668  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
328 aa  668  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  97.87 
 
 
329 aa  639  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  89.2 
 
 
335 aa  594  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  84.91 
 
 
320 aa  550  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  83.65 
 
 
320 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  66.48 
 
 
363 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  68.71 
 
 
349 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  66.2 
 
 
358 aa  474  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  66.48 
 
 
355 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  68.62 
 
 
347 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  68 
 
 
345 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  66.38 
 
 
350 aa  468  1e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  66.76 
 
 
353 aa  468  1e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  65.71 
 
 
353 aa  469  1e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  64.61 
 
 
361 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  66.37 
 
 
350 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  64.08 
 
 
355 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  66.56 
 
 
326 aa  440  1e-122  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  62.73 
 
 
343 aa  416  1e-115  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  63.72 
 
 
320 aa  405  1e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  57.06 
 
 
374 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  55.83 
 
 
360 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  57.14 
 
 
354 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  54.77 
 
 
367 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  56.02 
 
 
364 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  61.59 
 
 
332 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  53.91 
 
 
369 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  58.68 
 
 
323 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  58.39 
 
 
323 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  58.54 
 
 
323 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  52.78 
 
 
365 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  57.86 
 
 
323 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  57.86 
 
 
323 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  55.8 
 
 
323 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  67.4 
 
 
393 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  49.84 
 
 
324 aa  314  1e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  48.32 
 
 
404 aa  310  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  50.76 
 
 
337 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  49.38 
 
 
328 aa  306  4e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  47.38 
 
 
394 aa  305  8e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  47 
 
 
324 aa  289  5e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 
322 aa  283  2e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  63.98 
 
 
493 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  44.15 
 
 
347 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  43.75 
 
 
319 aa  274  1e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.44 
 
 
319 aa  272  5e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.71 
 
 
316 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.71 
 
 
316 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.71 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  43.08 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 
319 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  44.24 
 
 
339 aa  270  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.71 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  43.71 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.77 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.77 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  56.48 
 
 
460 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  57.87 
 
 
457 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  41.09 
 
 
352 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  42.11 
 
 
360 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  57.41 
 
 
449 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  56.94 
 
 
449 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  56.48 
 
 
449 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  51.18 
 
 
452 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  56.02 
 
 
460 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  56.02 
 
 
460 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  43.18 
 
 
375 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  40.4 
 
 
353 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  41.04 
 
 
349 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  39.19 
 
 
350 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  38.7 
 
 
359 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  45.11 
 
 
327 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  44.55 
 
 
346 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  43.59 
 
 
369 aa  254  2e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  39.37 
 
 
351 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  39.17 
 
 
362 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  44.19 
 
 
360 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  40.87 
 
 
329 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  38.94 
 
 
359 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  41.23 
 
 
347 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  40.23 
 
 
356 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  39.71 
 
 
343 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  35.79 
 
 
384 aa  246  5e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  38.61 
 
 
362 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.12 
 
 
362 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.59 
 
 
357 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  38.5 
 
 
363 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  37.95 
 
 
387 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  36.96 
 
 
352 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  37.64 
 
 
393 aa  235  1e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  38.14 
 
 
359 aa  234  2e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
395 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  37.36 
 
 
393 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  36.19 
 
 
363 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  37.57 
 
 
388 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  37.85 
 
 
359 aa  233  4e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  37.82 
 
 
388 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  38.69 
 
 
384 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  35.65 
 
 
362 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>