37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2011 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  98.52 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  95.49 
 
 		 135 aa  257  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  77.05 
 
 		 131 aa  189  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  73.23 
 
 		 127 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  80.62 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  64.29 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  63.64 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  62.02 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  65.32 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  61.48 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  61.48 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  61.48 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  55.65 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  58.2 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  58.2 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  54.84 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  59.7 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  55.74 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  51.2 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  57.38 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  55.28 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  55.28 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  51.2 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  51.2 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  54.84 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  52.38 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  49.59 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  47.97 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  48.09 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  46.03 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  46.72 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  42.98 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.98 
 
 		 546 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.14 
 
 		 535 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.51 
 
 		 579 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  26.61 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>