More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1670 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  45.99 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  44.53 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  41.32 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  44.26 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  49.5 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  36.09 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  44.23 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  40.5 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40.77 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  48.54 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  45.1 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  46.6 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  48.08 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  45.87 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  41.75 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  48.48 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  46.53 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  43.81 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  46.88 
 
 		 238 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  47.12 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  47.12 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  40.98 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  44.12 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  44 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  45.54 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  42.57 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  44.66 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  46.6 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  44.12 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  44 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  44 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  43.27 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  46.08 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  45.1 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  47 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  45.1 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  44.55 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40.78 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  37.4 
 
 		 178 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  46.08 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  42.99 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  45.63 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  41.9 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  45.1 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  41.9 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  43.81 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  43.14 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  41.84 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  40.95 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  41.9 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  46.6 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  44.55 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>