More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1779 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  62.16 
 
 
79 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  62.16 
 
 
79 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  61.04 
 
 
80 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  64.29 
 
 
84 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  61.04 
 
 
80 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  59.74 
 
 
80 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  61.04 
 
 
80 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  62.86 
 
 
85 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  64.71 
 
 
83 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  53.09 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  60 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  54.79 
 
 
77 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  60 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  54.05 
 
 
82 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  46.25 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  47.83 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  50.75 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  47.83 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  50 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  47.83 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  47.83 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  47.83 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  50 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  43.84 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  47.06 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  44.93 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  46.38 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  46.38 
 
 
81 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  46.05 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  44.93 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  48.53 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  44.93 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  50 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  44.12 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  44.12 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  46.38 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  44.12 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  44.12 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  45.59 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  44.93 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  42.03 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  44.16 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  44.29 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  41.56 
 
 
79 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  45.21 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  43.84 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  46.38 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  47.06 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  43.84 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  43.84 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  43.84 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  39.19 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  43.84 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  42.86 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.47 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  42.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  42.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  44.93 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  45.21 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  44.93 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  45.21 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.36 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  43.84 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  40.85 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  42.03 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  45.33 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.71 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  43.48 
 
 
75 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>