34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1076 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.32 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  48.17 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.15 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.59 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  43.65 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.98 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  27.6 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.65 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  24.51 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.44 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.61 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.4 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.83 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  22.56 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  22.92 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.65 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.67 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.37 
 
 		 550 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  20.71 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.32 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  21.21 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.81 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  21.67 
 
 		 553 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  21.54 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  20.92 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  28.68 
 
 		 545 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.87 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  22.95 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  22.95 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  21.5 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  21.83 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1496  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 851 aa  42.4  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0576  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.48 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.252977  normal  0.0673929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>