More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0507 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  67.88 
 
 
301 aa  424  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  45.03 
 
 
302 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.28 
 
 
302 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
300 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 
299 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 
299 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
296 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 
299 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
296 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 
299 aa  249  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 
298 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
302 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
297 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
300 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 
301 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  43.38 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 
301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
301 aa  241  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 
299 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 
311 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 
301 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 
303 aa  235  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 
301 aa  235  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  44.97 
 
 
297 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
300 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 
308 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 
314 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 
314 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 
298 aa  228  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  38.54 
 
 
314 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
297 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  38.94 
 
 
315 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
298 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 
296 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  40.85 
 
 
318 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
302 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 
299 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 
305 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  40.68 
 
 
324 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 
310 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
337 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40 
 
 
307 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  36.51 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
300 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 
312 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  38.03 
 
 
305 aa  217  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  35.59 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  40.14 
 
 
293 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  39 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
303 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
303 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
303 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  35.1 
 
 
300 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  35.97 
 
 
300 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
313 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 
310 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 
296 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  35.53 
 
 
310 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 
293 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  37.46 
 
 
301 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 
298 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  34.67 
 
 
303 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
301 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  34.77 
 
 
310 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  38.72 
 
 
338 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
299 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 
299 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  38.19 
 
 
314 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 
299 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 
302 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
301 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
301 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 
339 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 
339 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>