49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02657 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  27.93 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  28.96 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  30.48 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  28.32 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.78 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  25.68 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  26.59 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  26.59 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  27.17 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  27.17 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  25.43 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  29.9 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  28.18 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  26.52 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.67 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  28.65 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  26.95 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  25.99 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2691  hypothetical protein  25.87 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  24.82 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  30.11 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  23.08 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  30.91 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  23.28 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  24.62 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  26.47 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  22.99 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  22.99 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>