66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5080 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 138 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  75.89 
 
 		 141 aa  200  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  57.69 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  58.47 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  57.63 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  53.39 
 
 		 206 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  34.32 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  41.61 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  43.69 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  41.82 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  38.4 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  38.32 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  35.42 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  44.25 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  49.21 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  33.33 
 
 		 145 aa  57  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  41.82 
 
 		 242 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  32.31 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  40.71 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  41.74 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  42.61 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  42.98 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  46.34 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.03 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  39.22 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  39.39 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  39.58 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  27.78 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.62 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  26.85 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 		 109 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  28.87 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  24.77 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  36.62 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>