More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4610 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  77.03 
 
 		 235 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  74.77 
 
 		 251 aa  350  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  74.32 
 
 		 258 aa  348  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  74.66 
 
 		 225 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  62.17 
 
 		 229 aa  304  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  65.89 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  55.36 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  54.02 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  54.02 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  54.02 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  52.8 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  54.67 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  51.57 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  52.8 
 
 		 242 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  51.36 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  51.36 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  51.36 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  51.87 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  48.87 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  51.89 
 
 		 211 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  49.04 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  52.27 
 
 		 219 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  46.83 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  52.21 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  51.46 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  50.97 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  50.47 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  50.71 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  48.8 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  53 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  48.34 
 
 		 217 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  51.33 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  52.17 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  47.87 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  52.17 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  47.87 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  51.53 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  48.8 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  47.6 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  47.37 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  49.03 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  49.03 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  49.03 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  47.12 
 
 		 219 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.08 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  51.46 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  51.46 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  51.46 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  48.02 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  51.46 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  48.76 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  50.49 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  45.95 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  48.54 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  45.59 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  45.85 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  44.12 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  42.78 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  39.3 
 
 		 356 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  41.29 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 		 207 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  52.76 
 
 		 182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  45.69 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  41.67 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  42.11 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  39.81 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.46 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.02 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  37.14 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  40 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  41.51 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  36.23 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.25 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.71 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  37.86 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  34.17 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  40.72 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  36.54 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  36.54 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  37.98 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>