24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2258 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  82.14 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  55.77 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  53.7 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  54.46 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  51.52 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  53.33 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  47.47 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  42.98 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  45.45 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  49.04 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  46.85 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  36.67 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  37.37 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  35.63 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3522  phasin family protein  33.33 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  34.41 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.25 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  28.57 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  30.12 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  29.07 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0789  hypothetical protein  33.73 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0985376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  25.71 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>