23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4538 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  220  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  53.7 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  55.56 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  47.96 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  44.86 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  46.73 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  48.15 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  45.1 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  39.6 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  42.57 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  39.25 
 
 		 299 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  35.56 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  33.98 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  27.43 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  37.31 
 
 		 235 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  27 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  29.41 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  28.42 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.41 
 
 		 143 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>