20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2539 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  229  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  61.98 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  67.96 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  62.62 
 
 		 123 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  49.06 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  47.17 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  44.95 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  41.96 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  40.37 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  40.2 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  42.16 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  35.58 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  30.21 
 
 		 235 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  36.49 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  30.53 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  30 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  25.49 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  25.84 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>