15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2407 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3522  phasin family protein  47.12 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  35.63 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  36.36 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  34.48 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  35.23 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  28.41 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  28.41 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  34.52 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  26.14 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>