21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1115 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  68.81 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  66.67 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  67.31 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  50.93 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  48.15 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  47.06 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  45.54 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  50.94 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  47.17 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  47.66 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  42.59 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  43.3 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  34.38 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  34.09 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  37.37 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  31.08 
 
 		 299 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  31.36 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3522  phasin family protein  28.57 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  28.97 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>