17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1923 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  270  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  49.56 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  48.62 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  35.51 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  41.3 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  42.17 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  38.14 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  35.64 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  31.68 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  35.51 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  33.66 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  32.35 
 
 		 235 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  30.53 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  34.52 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>