21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4776 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  68.47 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  60.36 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  61.26 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  52.43 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  53.33 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  49.07 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  49.51 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  44.12 
 
 		 117 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  42.16 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  42.45 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  39.62 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  39.45 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  31.68 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  30.21 
 
 		 299 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  34.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  28 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.07 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  29.47 
 
 		 288 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  25 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  31.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>