19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1284 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  100 
 
 		 235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  44.93 
 
 		 144 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  35.5 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  37.84 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  41.58 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  34.09 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  32.99 
 
 		 123 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  33.68 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  30.68 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  31.96 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  34.04 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  34.41 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  34.02 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  29.55 
 
 		 288 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  32.35 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  37.31 
 
 		 114 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>