24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0862 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  100 
 
 		 299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  43.42 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  42.35 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  35.03 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  33.63 
 
 		 177 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  39.25 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  35.48 
 
 		 112 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  31.13 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  35.42 
 
 		 113 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  31.63 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  31.63 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  37.84 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  36.49 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  36 
 
 		 123 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  32.32 
 
 		 116 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.96 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  31.08 
 
 		 117 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  30.53 
 
 		 136 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  33.33 
 
 		 1261 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0155  phasin family protein  23.53 
 
 		 157 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0789  hypothetical protein  37.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0985376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>