More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1041 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 467 aa  936    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  64.92 
 
 		 524 aa  619  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  63.56 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  57.99 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  59.06 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  57.84 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  58.97 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  58.61 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  57.62 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  56.22 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  56.22 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  53.63 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  52.53 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  53.44 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  53.9 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  53.44 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  53.44 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  54.85 
 
 		 485 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  53.91 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  53.06 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  53.2 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  53.21 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  50.86 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  53.2 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  53.44 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  49.68 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  50.22 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  50.87 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  50.22 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  49.57 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  50.43 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  50.43 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  49.36 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  50.22 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  50 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  50.43 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  50.22 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  50.22 
 
 		 473 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  50.22 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  50.22 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  49.68 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  54.91 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  50 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  50 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  56.7 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  48.39 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  48.28 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  48.07 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  48.18 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  54.46 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  48.89 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  45.92 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  47.1 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  47.1 
 
 		 470 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  43.88 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  41.99 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  41.75 
 
 		 489 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 527 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  39.5 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  39.29 
 
 		 488 aa  348  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  39.29 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  39.58 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  39.58 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  39.58 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  39.29 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  39.37 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  39.37 
 
 		 488 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  39.37 
 
 		 488 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0954  lysine-specific permease  41.08 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  41.23 
 
 		 490 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  38.87 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  39.67 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  41.39 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  41.53 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  38.72 
 
 		 488 aa  336  5e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  41.39 
 
 		 526 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  41.39 
 
 		 526 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  40.81 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  41.39 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  38.54 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  39.19 
 
 		 520 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3839  amino acid permease-associated region  41.9 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.301841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1821  lysine-specific permease  38.79 
 
 		 489 aa  332  9e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 		 514 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  38.79 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  39.19 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  39.19 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  39.19 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  38.79 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  40.14 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  39.19 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>