More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0892 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 429 aa  883    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  42.89 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  43.69 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  43.78 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  39.12 
 
 		 437 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  39.17 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  38.63 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  38.2 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  38.2 
 
 		 430 aa  302  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  38.2 
 
 		 430 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  38.44 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  38.2 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  38.2 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  38.54 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  38.2 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  37.96 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  37.96 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  37.18 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  35.5 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  35.5 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  35.57 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  38.48 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  29.27 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  28.81 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  25.94 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  27.87 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  25.43 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  26.25 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.01 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  26.1 
 
 		 479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  25.18 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  24.63 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  27.16 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  25.08 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.64 
 
 		 470 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  22.8 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  25.54 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  25.61 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  24.46 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  24.42 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  26.16 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  22.28 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  22.89 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  23.11 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.36 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  26.19 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  23.67 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  24.15 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  23.46 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  24.75 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  25.54 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  23.81 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  24.17 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.77 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  25.23 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.03 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  24.94 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  26.44 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  24.63 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  21.79 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  21.79 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  24.23 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  23.75 
 
 		 476 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  23.56 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  22.93 
 
 		 480 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.92 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  23.62 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  27.1 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  23.17 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  23.5 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  23.66 
 
 		 470 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  23.98 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  24.12 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  25.23 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  23.41 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  23.21 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  26.3 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  25.47 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  26.61 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  24.1 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  23.84 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  23.17 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  23.26 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  23.96 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  24.34 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  23.21 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  23.69 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  26.63 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  22.7 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  23.17 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  23.17 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  24.64 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  23.17 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.73 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>