More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1220 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  48.81 
 
 
263 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  53.45 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  47.6 
 
 
258 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  49.58 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  44.75 
 
 
272 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  43.82 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  41.63 
 
 
261 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  44.44 
 
 
153 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  46.15 
 
 
152 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  39.68 
 
 
174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  44.74 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  49.49 
 
 
656 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  45.74 
 
 
149 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  41.55 
 
 
196 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  40.78 
 
 
110 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  40.78 
 
 
110 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  39.09 
 
 
110 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  39.62 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  38.89 
 
 
110 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  43.62 
 
 
112 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
102 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  37.37 
 
 
106 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  38.83 
 
 
110 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  38 
 
 
106 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  42.27 
 
 
108 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  42.11 
 
 
106 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  39.6 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  44.07 
 
 
490 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  37.37 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  39.22 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  39.18 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  37.5 
 
 
107 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.4 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
123 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 
106 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  38.14 
 
 
108 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  34.95 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  36.19 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 
109 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  41.74 
 
 
583 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  35.24 
 
 
109 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 
109 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 
109 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  35.42 
 
 
101 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  34.95 
 
 
106 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  37.88 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 
108 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  40 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  42.86 
 
 
870 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  36.46 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.43 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  37.89 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  34.69 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  34.62 
 
 
110 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  37.08 
 
 
102 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36.11 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  39.32 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  42.99 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  39.24 
 
 
110 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
101 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  36.46 
 
 
108 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.43 
 
 
1585 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
466 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
101 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.86 
 
 
148 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
101 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  37.7 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  43.12 
 
 
427 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  40 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.49 
 
 
762 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.27 
 
 
1402 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>