267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4049 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.86035e-07 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  82.43 
 
 
234 aa  362  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  74.65 
 
 
236 aa  324  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  72.52 
 
 
236 aa  322  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  71 
 
 
237 aa  319  2e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 
239 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  69.2 
 
 
231 aa  317  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  72.56 
 
 
227 aa  311  7e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  69.82 
 
 
223 aa  306  2e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  68.95 
 
 
232 aa  303  1e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0217  orotate phosphoribosyltransferase  69.58 
 
 
251 aa  303  2e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  65.32 
 
 
225 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  66.82 
 
 
233 aa  287  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  62.9 
 
 
222 aa  281  5e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 
213 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2485  orotate phosphoribosyltransferase  66.36 
 
 
213 aa  274  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  62.78 
 
 
225 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  62.78 
 
 
225 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  61.14 
 
 
237 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  61.97 
 
 
212 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  59.82 
 
 
214 aa  255  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1724  orotate phosphoribosyltransferase  63.96 
 
 
222 aa  255  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.286462  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  59.53 
 
 
228 aa  255  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  59.35 
 
 
216 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0108  orotate phosphoribosyltransferase  57.94 
 
 
213 aa  244  1e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0895164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  56.54 
 
 
212 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  57.87 
 
 
213 aa  239  3e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
215 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.47946e-12 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70370  orotate phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
213 aa  233  2e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
213 aa  233  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6107  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
213 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
211 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 
213 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
219 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
213 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  53.24 
 
 
214 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
213 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02880  orotate phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
213 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 
245 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  5.42739e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4383  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4846  orotate phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
213 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116277  decreased coverage  6.39801e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
213 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
215 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2998  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
220 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
215 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
215 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
214 aa  225  5e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  224  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  5.79905e-11 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
213 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
224 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0154  orotate phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
213 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
215 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0353  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
215 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3964  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
215 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
215 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3843  orotate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
213 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
213 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
233 aa  221  5e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
213 aa  221  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  52.09 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.70079e-05  unclonable  9.43905e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  221  1e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  221  1e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28483e-07 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4281  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
217 aa  220  1e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  221  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
213 aa  220  2e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4567  orotate phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
213 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  2.10498e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0181  orotate phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
213 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0223943  hitchhiker  6.86039e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5340  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.161962  hitchhiker  0.00942663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5291  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5199  orotate phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3204  orotate phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
234 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
219 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
219 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5544  orotate phosphoribosyltransferase  54.84 
 
 
214 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0320  orotate phosphoribosyltransferase  52.34 
 
 
213 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
213 aa  216  3e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04047  orotate phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
213 aa  214  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  48.65 
 
 
221 aa  214  1e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3672  orotate phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
213 aa  213  2e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.145212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  53.27 
 
 
219 aa  212  4e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
215 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0181  orotate phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
213 aa  195  5e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  50.68 
 
 
513 aa  188  6e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03730  orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5)  44.93 
 
 
225 aa  183  2e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>