More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0982 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.47 
 
 		 299 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.84 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.64 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.44 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.44 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  45 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  53.82 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  55.56 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.82 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.05 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.56 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.97 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.46 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.45 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.01 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.84 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.38 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.03 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.01 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.93 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.93 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.93 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  54.2 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.93 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.32 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  46.82 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.69 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.19 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  45.82 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.63 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.66 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.72 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.82 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.76 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.19 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.71 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.71 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.71 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.05 
 
 		 309 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.56 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.12 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.75 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  45 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.52 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.01 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.13 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.2 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 325 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.45 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.76 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.77 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.08 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.69 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.97 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.51 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.62 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.57 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.29 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.67 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.29 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.71 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.6 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.14 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.87 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.81 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.54 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.39 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.45 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.75 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.21 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.86 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.53 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.41 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3445  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  39.26 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  45.88 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>