More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0560 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  100 
 
 		 413 aa  814    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  58.84 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  52.66 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  45.79 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  47.69 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  45.61 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  48.99 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  48.97 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  48.63 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.22 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  48.22 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  46.67 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  46.67 
 
 		 396 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  47.58 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  47.58 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  47.19 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  46.23 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  44.27 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  47.62 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  45.36 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  46.92 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  49.35 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  47.19 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  44.47 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  44.72 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  47.72 
 
 		 385 aa  299  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  45.57 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  49.01 
 
 		 389 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  43.32 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  48.76 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  45.29 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  47.12 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  46.31 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  46.9 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  46.1 
 
 		 1305 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.98 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  46.4 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  44.62 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  50.37 
 
 		 1230 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  43.98 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  44.88 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  48.79 
 
 		 1228 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.55 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  44.87 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  44.13 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.73 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  43.46 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  41.9 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  45.61 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  42.53 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  45.45 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  45.7 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  45.7 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.28 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  49.63 
 
 		 1230 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  45.88 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  43.96 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  45.45 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  45.45 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  43.15 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  45.45 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  42.29 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  42.18 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  41.27 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  43.88 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  42.2 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  42.2 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  39.6 
 
 		 401 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  45.61 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  46.9 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  46.9 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  46.61 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.75 
 
 		 396 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  36.07 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  43.63 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  40.99 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  41.06 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  37.02 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  42.33 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  41.21 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  40.19 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  42.51 
 
 		 407 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  38.05 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  45.83 
 
 		 371 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  38.85 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  35.71 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  39.04 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.66 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  44.08 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  44.95 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  38.26 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  38.26 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  38.26 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  38.26 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  35.87 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  40.05 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  41.87 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  38.5 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>