More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0298 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  100 
 
 		 145 aa  286  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  83.21 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  83.21 
 
 		 137 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  77.78 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  81.34 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  76.39 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  76.39 
 
 		 144 aa  216  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  76.39 
 
 		 144 aa  216  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  77.08 
 
 		 144 aa  216  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  76.3 
 
 		 143 aa  216  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  75 
 
 		 144 aa  215  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  75.35 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 137 aa  209  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  66.9 
 
 		 145 aa  203  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  65.97 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  67.36 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  63.45 
 
 		 145 aa  192  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  65.28 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  64.58 
 
 		 144 aa  190  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  63.19 
 
 		 144 aa  189  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  63.19 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  63.45 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  70.34 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  67.15 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  60.42 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  65.69 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  61.97 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  61.33 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  65.91 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 137 aa  179  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  63.45 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  63.31 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  61.11 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  64.39 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  59.59 
 
 		 147 aa  175  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  63.45 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  57.46 
 
 		 140 aa  174  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  60.87 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  63.64 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  62.12 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  60.56 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  56.94 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  53.79 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  57.66 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  60.43 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  57.45 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  53.79 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  61.36 
 
 		 139 aa  170  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  55.17 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  59.56 
 
 		 141 aa  170  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  56.46 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  59.86 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0261  ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17421  50S ribosomal protein L16  56.46 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  58.96 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  58.99 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  57.55 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  55.1 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  58.7 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  60.45 
 
 		 179 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  59.26 
 
 		 158 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  58.27 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  58.27 
 
 		 139 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  58.09 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  56.64 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  56.64 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  57.04 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  57.35 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 137 aa  166  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>