211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1442 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  76.92 
 
 		 65 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  74.19 
 
 		 65 aa  97.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  56.36 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  56.36 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  44.44 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  40 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  48.21 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  52.94 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>