More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0231 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.92076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  78.63 
 
 
131 aa  213  6e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.88818e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  77.78 
 
 
130 aa  204  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  78.57 
 
 
130 aa  203  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  6.06121e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  77.95 
 
 
130 aa  203  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.8456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  75.59 
 
 
130 aa  193  5e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.90069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  3.59543e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.40848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.61179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.43375e-08  hitchhiker  9.12351e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  74.8 
 
 
130 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.49206e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  74.02 
 
 
130 aa  190  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.24807e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  74.02 
 
 
130 aa  189  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.33435e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  74.02 
 
 
130 aa  189  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.33856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  71.76 
 
 
131 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.55899e-13  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  80.95 
 
 
130 aa  187  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  74.02 
 
 
130 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.70079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  70.87 
 
 
130 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  70.87 
 
 
130 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  70.87 
 
 
130 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
130 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.4243e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  64.84 
 
 
130 aa  167  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
130 aa  167  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  8.31765e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  65.65 
 
 
131 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.58686e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  65.65 
 
 
131 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  73.23 
 
 
130 aa  164  3e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  62.2 
 
 
130 aa  164  3e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.18866e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  63.11 
 
 
129 aa  163  6e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.35637e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 
130 aa  163  7e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.50135e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  66.14 
 
 
130 aa  163  7e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.25135e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 
130 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.3775e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  61.42 
 
 
132 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.43747e-07  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  60.63 
 
 
130 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  61.42 
 
 
130 aa  154  5e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.9624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  60.47 
 
 
133 aa  153  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  63.78 
 
 
132 aa  152  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.07473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  148  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  4.52354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  59.09 
 
 
132 aa  148  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.61308e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
132 aa  148  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 
130 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.06629e-09  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  62.6 
 
 
134 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  59.2 
 
 
130 aa  146  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  58.02 
 
 
130 aa  146  1e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  58.78 
 
 
130 aa  145  1e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  1.10111e-08  hitchhiker  4.73134e-10 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  61.42 
 
 
132 aa  145  2e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  59.54 
 
 
130 aa  144  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.29825e-06  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  59.2 
 
 
130 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.26027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 
131 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.41683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
158 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.44699e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  57.69 
 
 
131 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  4.67508e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  52.34 
 
 
129 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.69489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0506  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
132 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  8.93397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0483  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
132 aa  141  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.45044e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_448  ribosomal protein S9  56 
 
 
132 aa  141  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.84365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  52.34 
 
 
129 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  59.2 
 
 
169 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  57.04 
 
 
135 aa  140  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
160 aa  139  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 
170 aa  139  1e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  58.4 
 
 
162 aa  139  1e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
131 aa  138  2e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
130 aa  138  2e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  139  2e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.13039e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
169 aa  139  2e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
160 aa  138  2e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
136 aa  139  2e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
160 aa  138  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
165 aa  139  2e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  56.35 
 
 
130 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  5.85971e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  137  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  137  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  60.8 
 
 
171 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.96861e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 
132 aa  137  4e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
130 aa  137  4e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.2665e-08  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  52.27 
 
 
132 aa  137  5e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  137  5e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  137  5e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
188 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
136 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.47442e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  60.15 
 
 
131 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 
166 aa  137  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
180 aa  136  8e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  58.14 
 
 
131 aa  136  8e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  54.2 
 
 
131 aa  136  9e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  136  9e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  136  9e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  136  9e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  136  9e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  136  9e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>