More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1909 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
291 aa  593  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  39.87 
 
 
312 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  39.02 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  32.59 
 
 
331 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
350 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
331 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  32.99 
 
 
303 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
347 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  28.62 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
334 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  30.41 
 
 
334 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  29.19 
 
 
327 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  29.43 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  28.57 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  37.44 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  37.13 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  28.7 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  29.34 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  32.91 
 
 
328 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  30.9 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  34.84 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  33.05 
 
 
340 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  34.43 
 
 
357 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  32.2 
 
 
342 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  31.05 
 
 
279 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  30.74 
 
 
346 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
343 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
340 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  33.18 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
326 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  29.21 
 
 
370 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  30.24 
 
 
353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  29.9 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  29.9 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  31.3 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  27.05 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
360 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  30.85 
 
 
328 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
334 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  29.55 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
341 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
438 aa  95.5  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
346 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  25.53 
 
 
346 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
607 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
369 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
608 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  28.63 
 
 
441 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  30.19 
 
 
357 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
600 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  26.03 
 
 
346 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
374 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  30.29 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
554 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.57 
 
 
1051 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
376 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  28.85 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
680 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  27.54 
 
 
747 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  28.76 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  25.57 
 
 
518 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.31 
 
 
587 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  27.36 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  28.76 
 
 
587 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
603 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.33 
 
 
587 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
465 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  24.68 
 
 
501 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  28.02 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
468 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  29.77 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  30.47 
 
 
593 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
587 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
375 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.76 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.76 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  29.47 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>