More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0964 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  65.29 
 
 
318 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
318 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
307 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
311 aa  219  4e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.23 
 
 
322 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.07 
 
 
318 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
312 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
315 aa  197  2e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
325 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5709  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.82 
 
 
316 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
299 aa  180  3e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
296 aa  180  3e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.48 
 
 
317 aa  179  5e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
299 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
306 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
290 aa  174  2e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
315 aa  172  6e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
306 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
305 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 
307 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
307 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
314 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
317 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
291 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.69 
 
 
320 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
300 aa  166  6e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
314 aa  165  7e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0178534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
293 aa  164  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
315 aa  165  1e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
320 aa  165  1e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
309 aa  164  2e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
318 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
309 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.39 
 
 
293 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
314 aa  163  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
318 aa  162  8e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
295 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2725  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
315 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.51 
 
 
301 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
308 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
299 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
308 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  33.8 
 
 
293 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
294 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
312 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
293 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
314 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.00699e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
299 aa  156  5e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625202  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
310 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
310 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
307 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
310 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
295 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.613698  normal  0.150229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
316 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
309 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.02 
 
 
305 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
310 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
312 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772545  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
316 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.11 
 
 
310 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
310 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
316 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
288 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  36.97 
 
 
313 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.33 
 
 
310 aa  153  3e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
310 aa  153  3e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
316 aa  154  3e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
308 aa  153  3e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
299 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.33 
 
 
310 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
310 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  32.76 
 
 
306 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
294 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
321 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
310 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.33 
 
 
310 aa  152  6e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
279 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
316 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
320 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.19 
 
 
303 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
296 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
295 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
310 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
305 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
307 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
299 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
317 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
293 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
312 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
307 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.96099e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
314 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
302 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
307 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
308 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
290 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  33.8 
 
 
294 aa  148  1e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
313 aa  148  1e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
312 aa  148  1e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>