39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2383 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 428 aa  851    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  62.35 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  60.55 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  63.58 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  61.54 
 
 		 1001 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  57.31 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  62.42 
 
 		 692 aa  332  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  58.86 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  71.79 
 
 		 767 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  64.59 
 
 		 233 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  59.91 
 
 		 380 aa  269  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  62.98 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  60.39 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  59.09 
 
 		 524 aa  245  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  52.89 
 
 		 225 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  52.02 
 
 		 221 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  43.67 
 
 		 337 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  51.34 
 
 		 1160 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  52.27 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  56.16 
 
 		 212 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  53 
 
 		 212 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  49.78 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  47.62 
 
 		 298 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  47.27 
 
 		 683 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 221 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  47.31 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  55.29 
 
 		 815 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  31.14 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0475  polysaccharide deacetylase  42.17 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0117021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  37.62 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  23.7 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  38.05 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  32.65 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.04 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  33.98 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.69 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  36.08 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>