More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2343 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  937    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  45.39 
 
 		 517 aa  362  6e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 513 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.86 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 494 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  38.25 
 
 		 475 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 544 aa  279  8e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  39.95 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  36.5 
 
 		 491 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  36.06 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  37.33 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  49.29 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  34.42 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  36.24 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 537 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7131  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 509 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 366 aa  180  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  38.54 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 504 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.63 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  32.31 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.67 
 
 		 481 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.51 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.73 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.82 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  31.67 
 
 		 472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  35.74 
 
 		 566 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  36.73 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  30.49 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 640 aa  149  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  29.29 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  30 
 
 		 473 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 474 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 310 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.15 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  30 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  34.63 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.1 
 
 		 508 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.56 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.72 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.03 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 490 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  35.36 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 639 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  29.67 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  28.48 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>