44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1393 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  54.65 
 
 		 329 aa  341  9e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  44.11 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  28.65 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.98 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  28.74 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.86 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.81 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  31.07 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  27.65 
 
 		 370 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.57 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.78 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  24.1 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.65 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  26.69 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  22.68 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  24.92 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  22.22 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  23.64 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.27 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  23.12 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.6 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.34 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  24.64 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  23.11 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.92 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  22.07 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  26.37 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  24.45 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  22.16 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  26.03 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  24.14 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.77 
 
 		 753 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  24.62 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  25.25 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  22.08 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  22.67 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  26.99 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.23 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.49 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  23.05 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.47 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  24.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>