54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2129 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2129  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 128 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.027285  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0350  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.54 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.04 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.04 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.04 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.65 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  38.46 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.82 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.9 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.11 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  36.84 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.2 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.66 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.14 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.42 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.14 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  23.48 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.73 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1437  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  34 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.63 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.09 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.38 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.03 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  21.85 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  54.76 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.39 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.92 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.05 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  27.03 
 
 		 134 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.12 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  25.64 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.91 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  21.36 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  23.88 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  26.89 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.93 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  42.22 
 
 		 174 aa  40  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>