More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1768 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  70.05 
 
 
201 aa  270  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  70.26 
 
 
195 aa  266  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  67.5 
 
 
200 aa  259  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  71.67 
 
 
204 aa  255  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.11 
 
 
217 aa  141  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.31 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.44 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.71 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.71 
 
 
241 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.23 
 
 
191 aa  135  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.62 
 
 
216 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.06 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  39.01 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.43 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.96 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.13 
 
 
271 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.02 
 
 
264 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.85 
 
 
264 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  37.5 
 
 
195 aa  131  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.33 
 
 
330 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.23 
 
 
187 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.95 
 
 
341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.62 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.84 
 
 
346 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.84 
 
 
346 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.84 
 
 
342 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.63 
 
 
209 aa  128  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  45.86 
 
 
292 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.95 
 
 
217 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.82 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.23 
 
 
433 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.85 
 
 
317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.44 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.22 
 
 
367 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.54 
 
 
210 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.17 
 
 
358 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.94 
 
 
401 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.91 
 
 
273 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.59 
 
 
220 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
345 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.51 
 
 
249 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.59 
 
 
468 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.04 
 
 
304 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  43.59 
 
 
455 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.59 
 
 
455 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.59 
 
 
455 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  43.59 
 
 
455 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  43.59 
 
 
455 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.56 
 
 
264 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.24 
 
 
200 aa  123  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.74 
 
 
380 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
221 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.64 
 
 
210 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.42 
 
 
285 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  39.55 
 
 
206 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.51 
 
 
189 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.72 
 
 
414 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.8 
 
 
186 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.16 
 
 
255 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.47 
 
 
190 aa  121  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.07 
 
 
219 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.02 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.88 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.89 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  32.8 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.56 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.7 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.7 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.11 
 
 
203 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0231  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.2 
 
 
252 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0104568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  40.99 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.04 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  42.68 
 
 
213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  37.57 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.83 
 
 
225 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.37 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  33.92 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.61 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.37 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.22 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.83 
 
 
301 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.24 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.78 
 
 
259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.75 
 
 
264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.84 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.85 
 
 
294 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.24 
 
 
187 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.9 
 
 
209 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.76 
 
 
219 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.65 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.97 
 
 
205 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.82 
 
 
217 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 
300 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.95 
 
 
249 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
206 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.12 
 
 
289 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.43 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>