More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  100 
 
 
88 aa  173  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  75.58 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  68.97 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  71.6 
 
 
89 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  70.93 
 
 
89 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 
89 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
89 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  69.77 
 
 
90 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  70.93 
 
 
89 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  69.14 
 
 
100 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  70.93 
 
 
89 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  68.6 
 
 
89 aa  120  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  120  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  69.77 
 
 
89 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  64.77 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
88 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  66.67 
 
 
89 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  70.37 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 
89 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  65.52 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  65.12 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  66.28 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 
89 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  66.28 
 
 
89 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.28 
 
 
87 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  67.9 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  65.06 
 
 
91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  66.28 
 
 
89 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  63.22 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  65.12 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  60.47 
 
 
89 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  65.12 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  64.2 
 
 
84 aa  110  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.63 
 
 
89 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  61.63 
 
 
89 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
126 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
90 aa  110  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
90 aa  110  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
91 aa  110  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  59.3 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>