54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5104 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
199 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  29.31 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  27.98 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  30.19 
 
 
122 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  26.4 
 
 
151 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  31.91 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  23.89 
 
 
137 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  25.89 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  24.27 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  24.27 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  26.55 
 
 
138 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  31.96 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  25.51 
 
 
282 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  24.49 
 
 
267 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  25.22 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  24.49 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  25.25 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.17 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  24.49 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  24.49 
 
 
278 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  23.96 
 
 
119 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  28.74 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  32.26 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  23.97 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  24.47 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  22.58 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  26.97 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  25.49 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  24.3 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  23.89 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  20.83 
 
 
135 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  29.13 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  25.24 
 
 
135 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  25.51 
 
 
115 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  26.97 
 
 
142 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  24.39 
 
 
148 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  26.97 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  26.97 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  23.58 
 
 
158 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  41.2  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>