More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3272 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  100 
 
 		 611 aa  1207    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.17 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  43.84 
 
 		 471 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.99 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.76 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  34.7 
 
 		 654 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  34.79 
 
 		 642 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.25 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.96 
 
 		 810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.09 
 
 		 586 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.89 
 
 		 600 aa  201  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.76 
 
 		 602 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 		 609 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.29 
 
 		 613 aa  196  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.42 
 
 		 789 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  34 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.74 
 
 		 611 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  34 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  34 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 624 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  33.01 
 
 		 603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.95 
 
 		 567 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  32.27 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  32.51 
 
 		 586 aa  191  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.95 
 
 		 567 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.96 
 
 		 565 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.18 
 
 		 631 aa  190  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.96 
 
 		 565 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.49 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.71 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.71 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.71 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.73 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.49 
 
 		 565 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 565 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  32.84 
 
 		 630 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  36.39 
 
 		 623 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.76 
 
 		 592 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 613 aa  187  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.71 
 
 		 752 aa  186  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 563 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.97 
 
 		 570 aa  186  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.85 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 619 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.52 
 
 		 619 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.64 
 
 		 610 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.61 
 
 		 613 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.18 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.84 
 
 		 626 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.25 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.37 
 
 		 613 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.4 
 
 		 561 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.01 
 
 		 583 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.09 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  32.88 
 
 		 750 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.34 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.52 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.28 
 
 		 619 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  30.62 
 
 		 731 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.43 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  30.69 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  33.92 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.75 
 
 		 624 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  32.76 
 
 		 577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  32.31 
 
 		 623 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.95 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  29.79 
 
 		 574 aa  171  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  34.27 
 
 		 610 aa  170  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  31.88 
 
 		 649 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.39 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.67 
 
 		 628 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  32.16 
 
 		 629 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  32.64 
 
 		 623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.85 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  32.9 
 
 		 632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  33 
 
 		 745 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.54 
 
 		 449 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  31.95 
 
 		 622 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  33.42 
 
 		 639 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.08 
 
 		 602 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.83 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  31.05 
 
 		 618 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.02 
 
 		 628 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  31.62 
 
 		 608 aa  160  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  32.62 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  30.44 
 
 		 626 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  29.36 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  30.12 
 
 		 605 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.59 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 		 616 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.05 
 
 		 616 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.43 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  30.79 
 
 		 631 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  31.07 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  30.1 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  31.58 
 
 		 600 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  30.83 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>