53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1908 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  100 
 
 		 301 aa  627  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  33.44 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  40.94 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  40.94 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  36.75 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  37.16 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  33.9 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.23 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  34.21 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  33.6 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  32.02 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  32.6 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  30.81 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  30.88 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  28.81 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  28.63 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  27.4 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  27.8 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  27.8 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  29.8 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  27.8 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  30.17 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  26.92 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  27.8 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  27.24 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  26.83 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  26.75 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  27.31 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  28.76 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  26.29 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  24.38 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  27.53 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.32 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  26.79 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  25.29 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.98 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.87 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  26.75 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  26.12 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  22.91 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.88 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.88 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  24.61 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  23.95 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  24.46 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  23.53 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  22.89 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  24.43 
 
 		 484 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  23.94 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  35 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>