204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1763 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  41.76 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  41.21 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  43.18 
 
 
191 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  43.18 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  41.21 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  41.75 
 
 
186 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  42.63 
 
 
186 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  40.11 
 
 
182 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  41.14 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  41.14 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  40.11 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  40.11 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  42.11 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  40.11 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  42.11 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  42.11 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  42.11 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  42.33 
 
 
207 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  42.33 
 
 
207 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  41.05 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  38.5 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  39.66 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  41.05 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  35.33 
 
 
187 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  41.05 
 
 
185 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  40.31 
 
 
186 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  41.58 
 
 
207 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  43.71 
 
 
185 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  43.71 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  34.05 
 
 
187 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  43.71 
 
 
186 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  39.89 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  39.25 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  39.57 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  41.76 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  40.12 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  38.46 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  38.46 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  38.97 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  37.64 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  40.68 
 
 
187 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  38.62 
 
 
186 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  39.78 
 
 
221 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  38.79 
 
 
191 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  36.31 
 
 
208 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  40.11 
 
 
183 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  37.71 
 
 
182 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  32.98 
 
 
194 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  40.85 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  34.73 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  36.02 
 
 
182 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  35.79 
 
 
194 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  39.52 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  40 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  37.37 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  36.56 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  41.9 
 
 
186 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  35.26 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  35.16 
 
 
193 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  36.76 
 
 
191 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  35.98 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  41.36 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  34.95 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  35.98 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  40.57 
 
 
197 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  38.24 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  39.43 
 
 
194 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  35.29 
 
 
182 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  38.29 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  39.55 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  33.16 
 
 
195 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  33.54 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  36 
 
 
187 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  35.43 
 
 
182 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  39.76 
 
 
187 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  36.05 
 
 
169 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  39.43 
 
 
187 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  35.8 
 
 
189 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  34.24 
 
 
217 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  33.53 
 
 
228 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.87 
 
 
182 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  35.29 
 
 
195 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  31.28 
 
 
219 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.42931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  31.91 
 
 
183 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  32.97 
 
 
182 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  33.53 
 
 
184 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  31.74 
 
 
183 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  32.95 
 
 
235 aa  99  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.34 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>